大体の目安としては、単一の、あるいはごく少数のプロジェクトに関係するだけの 問題を解決するためのコードは、PEAR の一部となるのに適しません。 そこから利益を得る人は、ほとんど誰もいないからです。
しかし、 "ニッチなソフトウエア" が PEAR に登録されない訳ではありません。 数値計算のセクションには、種々の代数的問題を解くための手の込んだパッケージがあります。 そういった代数的問題は平均的なアプリケーションには関係しませんが、 それらのパッケージは抽象的な科学的プロジェクトに対して大きな利益をもたらします。
一般性を欠くために PEAR に適さないものの他にも、現在の所、 PEAR では受け入れられないタイプのコードがあります。それは、完全な WEB アプリケーションです。 開発者向けのツール、例えば phpDocumentor などは受け入れていますが、 一般ユーザ向けのアプリケーションについては受け入れません。
PEAR の "A" は、"Application" を表しているのですが、 アプリケーションがサポートされていないことについては単純な理由があります。 現在のところ、完全な WEB アプリケーションのパッケージを扱えるような インフラ（PEAR インストーラなど）が開発されるに至っていないからです。
状況が変わりましたら、サイトを更新してお知らせする予定です。